انمي NieR:Automata Ver1.1a Part 2، القسم الثاني مع تقدم حرب الآلات، تستعد قيادة YoRHa والمقاومة لهجوم نهائي حاسم ضد "Machine Lifeforms"، الروبوتات العسكرية التي تجوب سطح الأرض. بينما تجري الاستعدادات، يواصل YoRHa 9-gou S-gata "9S" وYoRHa 2-gou B-gata "2B" مهمتهما الاستكشافية المتقدمة. ومع ذلك، فإن 9S و2B يتصارعان مع أدوار كل منهما، وولائهما لبعضهما البعض، وولائهما تجاه القيادة. يبدو أن الآلات لم تتوقف عن العد. يستمر الوجود المشؤوم على شكل "الفتاة الحمراء" في مراقبة الروبوتات من بعيد، في انتظار الفرصة المثالية لمهاجمتهم.
