انمي Phantasy Star Online 2 The Animation، في عام 2027، أصبحت لعبة الفيديو Phantasy Star Online 2 رائجة جدًا في أكاديمية سيجا . كل طالب ينضم إلى هذه الموضة، باستثناء إيتسوكي تاتشيبانا، وهو طالب متمكن لا يلعب ألعاب الفيديو. ونظرًا لشعبيتها، فإن اللعبة قيد المراجعة حاليًا في أكاديمية سيجا لمعرفة ما إذا كان لها تأثير سلبي على الطلاب. وبالتالي، فإن هذا يجعل إيتسوكي يلفت انتباه رينا إيزومي، رئيسة مجلس الطلاب الساعية إلى الكمال والتي تهدف إلى إثبات أن اللعبة ليست هي المسؤولة.
لتحقيق هدفها، قامت رينا بتعيين إيتسوكي كنائب لرئيس مجلس الطلاب وتكلفه بتعلم لعب اللعبة مع الحفاظ على درجاته مرتفعة. الآن مُجبر على إبلاغ رينا بنتائجه اليومية للعبة وتحليل مزاياها، ويحمل إتسوكي مصير Phantasy Star Online 2 بين يديه.