فيلم Suzumiya Haruhi no Shoushitsu (اختفاء هاروهي سوزوميا)، في يوم بارد من شهر ديسمبر، يصل كيون إلى المدرسة مستعدًا لرحلة أخرى مع زملائه أعضاء لواء الإنقاذ. ومع ذلك، ولدهشته الكبيرة، يكتشف أن كل شيء تقريبًا قد تغير تمامًا: لم يعد من الممكن العثور على هاروهي سوزوميا وإيتسوكي كويزومي في أي مكان؛ لم تتعرف عليه ميكورو أساهينا على الإطلاق؛ أصبحت يوكي ناغاتو إنسانًا عاديًا؛ وعادت ريوكو أساكورا بشكل غامض. على الرغم من أنه ليس غريبًا على ما هو خارق للطبيعة، إلا أن كيون منزعج من هذا التحول الغريب في الأحداث ويقرر التحقيق بمفرده.
بعد أن وجد نفسه الشخص الوحيد الذي يدرك الواقع السابق، يواجه كيون الآن خيارًا صعبًا: إما أن يعيش أخيرًا الحياة الطبيعية التي أرادها دائمًا، أو يكتشف طريقة لإعادة عقارب الساعة إلى الوراء واستعادة عالمه الفوضوي والمألوف.