فيلم Evangelion Movie 1: Jo، في عالم ما بعد نهاية العالم، تُعد مستوطنة أخرى للبشر في اليابان هي مدينة طوكيو-3 المحصنة بشكل كبير. يُحضَر الفتى البالغ من العمر أربعة عشر عامًا، شينجي إيكاري، إلى مقر منظمة نيرف، وهي منظمة تحت الأرض يقودها والده المنفصل، جيندو. يطلب من شينجي أن يصبح طيارًا لـ "إيفانجيليون"، وهو إنسان آلي ضخم يُبنى لمحاربة المخلوقات الفضائية العملاقة والمدمرة التي تُحدث الفوضى على الكوكب وتهدد بقاء الجنس البشري المتبقي.
على الرغم من تردده في البداية، يُقنع شينجي بفكرة التصالح مع والده، ويوافق على المساعدة في جهود الإنسانية الخطيرة ضد التهديد الفضائي، كطيار لوحدة إيفانجيليون-01. يُلقى شينجي في وسط ساحة حرب خطيرة، حيث يجب عليه أن يجد الشجاعة والإصرار الضروريين لمواجهة هجمات "الفضائيين" قبل فوات الأوان.